Meeresbiologe an der Çukurova-Universität und forscht im Rahmen der Forschunsgruppe “Mikroplastik”.  Er hat rund 100 Publikationen verfasst, von denen sich viele mit Kunststoffen und Mikroplastik befassen. Seine Forschung konzentriert sich auf die Verbreitung und die Auswirkungen der Plastikverschmutzung und befasst sich zudem mit dem „Abfallkolonialismus“ sowie dem internationalen Handel mit Plastikmüll. Er arbeitet mit zivilgesellschaftlichen Organisationen zusammen, um das Bewusstsein für die Plastikverschmutzung zu schärfen. 

Als Mercator-IPC-Stipendiat am Istanbul Policy Centre (IPC) der Sabancı-Universität hat er die klimatischen und diplomatischen Dimensionen des grenzüberschreitenden Handels mit Kunststoffabfällen zwischen Deutschland und der Türkei untersucht. Gündoğdu, Preisträger des Förderprogramms für junge Wissenschaftler der Akademie der Wissenschaften (BAGEP) 2024, ist Gründungsmitglied der Wissenschaftlerkoalition für ein wirksames Kunststoffabkommen und Mitglied des Sprecherrats für die Amtszeit 2026–2027.