Rodolfo Aguirre hat Wirtschaftswissenschaften studiert und besitzt einen Master-Abschluss in internationaler Betriebswirtschaftslehre von der Nationalen Autonomen Universität Mexiko. Er arbeitete als Wissenschaftler bereits zu verschiedensten Themen, u.a. Armut, öffentliche Politik, Menschenrechte und Wirtschaftsreformen in Mexiko. Darüber hinaus war er in verschiedenen Organisationen der Zivilgesellschaft, in der Regierung des Hauptstadtdistrikts (Mexiko-Stadt) und als Berater für UNICEF tätig.

Seit 2010 ist er Programmkoordinator im Bereich Demokratie der Heinrich-Böll-Stiftung in Mexiko.